Israel impuso además el toque de queda en las principales ciudades autónomas palestinas.
Mientras los tanques israelíes y los transportes blindados de tropas se acercaban al edificio hubo un intercambio de disparos en el que resultaron heridos dos efectivos de seguridad.
Un informe cita a testigos que indican que el ejército israelí voló el edificio contínuo a la oficina de Arafat.
El ejército de Israel no se ha pronunciado al respecto.
Más de 20 palestinos se entregaron al ejército de Israel.
Durante la noche, alrededor de 20 palestinos cuyo arresto ha sido solicitado por Israel salieron del complejo y se entregaron al ejército israelí.
El portavoz de Yasser Arafat, Nabil Abu Rudeinah, dijo a la BBC que la vida del líder palestino estaba en verdadero peligro y que era muy posible que Israel lo enviara al exilio.
Abu Rudeinah señaló asimismo que Arafat se encuentra en comunicación con líderes de los países arabes y europeos, tratando de organizar reuniones del Consejo de Seguridad de la ONU, cancilleres de la Liga Árabe y la comisión para Medio Oriente de la Unión Europea, Rusia, EE.UU. y las Naciones Unidas.