Itongadol/AJN.- Se detectó una nueva variante de coronavirus (SARS-CoV-2) con docenas de mutaciones en nuevas muestras recolectadas de pacientes en Israel y Dinamarca, y algunos virólogos y científicos de datos enfatizaron que, si bien es demasiado pronto para saber si la variante se propagará de manera efectiva, es lo suficientemente único como para justificar el seguimiento.
La muestra de la variante detectada en Israel se registró el 31 de julio, mientras que las dos muestras de la variante se detectaron en Dinamarca el 24 y el 31 de julio. Hay algunas diferencias menores entre las muestras de Israel y Dinamarca.
Shay Fleishon gives some details in his thread. Most of the mutations are in spike. It doesn't fit the profile of any major Omicron lineage—BA.1-5—but instead seems a hodgepodge of all of them with lots of additional spike mutations. Hence the BA.6 notion. https://t.co/ihnWu4txeh
— Ryan Hisner (@LongDesertTrain) August 13, 2023
Shay Fleishon, director ejecutivo de BioJerusalem y exasesor del Laboratorio Central de Virología del Centro Médico Sheba, señaló que la muestra de Israel se recolectó de un paciente que no padecía una enfermedad crónica, y las muestras adicionales de Dinamarca indicaron que esta variante se estaba propagando y no simplemente casos individuales de mutaciones extremas en pacientes con enfermedades crónicas o inmunodeprimidos.
La nueva variante parece descender de la variante BA.2 de SARS-CoV-19, aunque también tiene similitudes con otras variantes e incluso puede ser distinta de BA.2, según Ryan Hisner, un maestro ahora citado con frecuencia que es conocido por ser parte de una comunidad de rastreadores de variantes de coronavirus en todo el mundo.
Nuevo coronavirus SARS-CoV-2 (crédito: Wikimedia Commons)
Todavía no está claro si la nueva variante tendrá algún impacto
Si bien la nueva variante tiene más de 30 mutaciones en su proteína espiga, aún no está claro si logrará propagarse de manera eficiente o si simplemente desaparecerá como muchas otras variantes fuertemente mutadas.
Hisner señaló que la proteína de pico en las muestras es «muy diferente de cualquier otra que hayamos visto. Esto significa que probablemente evadirá la protección inmunológica contra la infección y la vacunación si es lo suficientemente adecuada como para propagarse ampliamente. Pero aún no sabemos si está lo suficientemente en forma para hacerlo».
This variant has a very different spike profile from any other we've seen. This means it will likely evade immune protection from infection & vaccination if it is fit enough to spread widely. But we don't know yet if it's fit enough to do so. It may note be. As for severity….
— Ryan Hisner (@LongDesertTrain) August 14, 2023
Hisner señaló que todavía es demasiado pronto para decir cuál será el impacto de la nueva variante, ya que hasta ahora solo se han encontrado tres secuencias y solo han pasado unos días desde que se grabaron las secuencias.
En respuesta a las preguntas sobre la importancia de la nueva variante, el virólogo Tom Peacock señaló que será difícil saberlo hasta que se realicen más análisis y se recolecten más muestras (si hay más casos) ya que muchas de las mutaciones registradas en la nueva variante se han registrado en el pasado, pero por lo general no han logrado difundirse ampliamente.
Flagging to @PeacockFlu & @CorneliusRoemer & @TWenseleers
To everyone else – v v early days but this coronavirus variant (now in 2 countries) has a LOT of new mutations that makes it v different to previous Omicron strains – and so potentially more able to cause a big wave. https://t.co/3kxcIRwrf4
— Prof. Christina Pagel (@chrischirp) August 14, 2023
Peacock señaló que esta es la primera saltación (un cambio mutacional repentino y grande) que se ha visto transmitirse entre pacientes en mucho tiempo.
Secuenciación reducida que dificulta el seguimiento de nuevas variantes
Peacock y otros rastreadores de variantes notaron que la secuenciación genética reducida de los casos de COVID-19 ha agregado dificultades para comprender la importancia de variantes como esta nueva.
El modelador de enfermedades infecciosas @JPWeiland, que también ha estado monitoreando la propagación de las variantes del coronavirus, señaló que solo se secuenciaron 91 casos en Dinamarca el mes pasado y solo 231 casos se secuenciaron en Israel el mes pasado, lo que significa que la variante podría estar más extendida sin ser detectada.
The variants we've seen since 2022 each only have a few S mutations at a time, so their potential was limited.
This unnamed new one has 24.
Omicron had 32.We don't know yet where this will land on this chart. Given the mutation profile, it has a much larger range of outcomes. pic.twitter.com/2Ps6zgjRiM
— JWeiland (@JPWeiland) August 14, 2023
Estados Unidos, Japón y el Reino Unido han informado ligeros aumentos en los casos y hospitalizaciones de COVID-19 en las últimas semanas.
A medida que nos acercamos a la caída, los científicos han expresado su preocupación de que la disminución de las pruebas y la secuenciación que se producen en todo el mundo dificultará el seguimiento de nuevas variantes.
Christina Pagel, profesora de investigación operativa en el University College London, le dijo a The Guardian a principios de este mes que pediría que las prácticas de monitoreo, incluido el monitoreo de aguas residuales, se incrementen nuevamente antes de la caída.
“Lo que más me preocupa es si volvemos a repetir la última crisis del NHS de invierno este invierno, con Covid, gripe y RSV golpeando al mismo tiempo”, dijo Pagel. «Definitivamente estamos volando casi a ciegas».
Ulrich Elling, líder de un grupo de investigación en el Instituto de Biotecnología Molecular de la Academia de Ciencias de Austria, calificó la tasa de secuenciación en todo el mundo como «una vergüenza» en un tweet reciente, y señaló que solo se secuenciaron 50 casos en África, 7.7 mil fueron secuenciados en Asia, 2,8 mil fueron secuenciados en Europa, 7,1 mil fueron secuenciados en América del Norte y 1000 fueron secuenciados en Oceanía.
“¿Realmente deberíamos llamar a eso vigilancia? ¿Cómo se supone que vamos a llamar las variantes relevantes antes? ¿Cómo debemos preparar las vacunas adecuadas a tiempo? ¿Cómo debemos modelar las epicurvas? añadió Elling. “La variante «Eris» EG.5.1, hija de XBB.1.9.2 con F456L y Q52H, está creciendo en Europa y en todo el mundo. Junto con el destete de la inmunidad después de un verano tranquilo en el hemisferio norte, el inicio inminente del otoño y la apertura de escuelas, veremos muchas más infecciones”.
A principios de este mes, Maria Van Kerkhove, líder técnica de la respuesta al COVID-19 en la OMS, instó a los estados miembros a “mantener, no desmantelar, la infraestructura COVID-19 establecida: mantener la vigilancia y los informes, el seguimiento de variantes, la provisión de atención clínica temprana, refuerzos de vacunas a grupos de alto riesgo, mejoras en la ventilación, comunicación, etc”.